本发明公开了脉冲电场协同臭氧制备低分子量水溶性壳聚糖的装置与方法，该方法将分子量大于１．０×１０５Ｄａ的高分子量壳聚糖溶于酸性溶液后置于夹套瓶的空心结构中，将臭氧由气体分散器导入高分子量壳聚糖酸性溶液中，打开恒温循环器，通入臭氧的壳聚糖酸性溶液经脉冲电场处理，得到降解液，经碱液调ｐＨ、洗涤和干燥得低分子量水溶性壳聚糖。该装置的臭氧壳聚糖溶液混合装置主要由夹套瓶、气体分散器、空气过滤器、恒温循环器和废气收集瓶组成；夹套瓶为带有夹套的空心结构，气体分散器和空气过滤器设置在夹套瓶的空心结构中；本发明工艺简单、降解速度快、制备的水溶性壳聚糖分子量可控性好、节能环保广。